Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRX1

Tom1l2, TOM1-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l2Q5SRX1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms