Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf12Q5SPL2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms