Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms