Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtp3Q5QGU6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms