Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6bQ5NCY0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm6bQ5NCY0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm6bQ5NCY0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm6bQ5NCY0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms