Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rapgef6Q5NCJ1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms