Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hs3st6Q5GFD5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms