Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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Nlrc3Q5DU56 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Nlrc3Q5DU56 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Nlrc3Q5DU56 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms