Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Fam208bQ5DTT3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Fam208bQ5DTT3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Fam208bQ5DTT3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Fam208bQ5DTT3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Fam208bQ5DTT3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fam208bQ5DTT3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fam208bQ5DTT3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fam208bQ5DTT3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Fam208bQ5DTT3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam208bQ5DTT3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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