Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eme2Q56A04 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eme2Q56A04 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms