Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spire1Q52KF3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms