Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD8

Nxf2, Nuclear RNA export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf2Q4ZGD8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nxf2Q4ZGD8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nxf2Q4ZGD8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nxf2Q4ZGD8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nxf2Q4ZGD8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nxf2Q4ZGD8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nxf2Q4ZGD8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxf2Q4ZGD8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxf2Q4ZGD8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxf2Q4ZGD8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxf2Q4ZGD8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxf2Q4ZGD8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxf2Q4ZGD8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxf2Q4ZGD8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxf2Q4ZGD8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxf2Q4ZGD8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxf2Q4ZGD8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxf2Q4ZGD8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxf2Q4ZGD8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nxf2Q4ZGD8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxf2Q4ZGD8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxf2Q4ZGD8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxf2Q4ZGD8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxf2Q4ZGD8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxf2Q4ZGD8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxf2Q4ZGD8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxf2Q4ZGD8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxf2Q4ZGD8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxf2Q4ZGD8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxf2Q4ZGD8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxf2Q4ZGD8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxf2Q4ZGD8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxf2Q4ZGD8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxf2Q4ZGD8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nxf2Q4ZGD8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nxf2Q4ZGD8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms