Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc27a5Q4LDG0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a5Q4LDG0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms