Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms