Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms