Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Garnl3Q3V0G7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Garnl3Q3V0G7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms