Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp48Q3V0C5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms