Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms