Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3UZV7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UZV7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UZV7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UZV7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UZV7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UZV7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3UZV7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3UZV7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3UZV7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3UZV7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3UZV7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UZV7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UZV7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UZV7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UZV7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UZV7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms