Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330034G19RikQ3UWX6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms