Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1lQ3USQ7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms