Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms