Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc190Q3URK1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc190Q3URK1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc190Q3URK1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc190Q3URK1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms