Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsponQ3UPR9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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