Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms