Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdgfl2Q3UMU9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdgfl2Q3UMU9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdgfl2Q3UMU9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdgfl2Q3UMU9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdgfl2Q3UMU9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdgfl2Q3UMU9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdgfl2Q3UMU9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdgfl2Q3UMU9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdgfl2Q3UMU9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdgfl2Q3UMU9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms