Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Washc4Q3UMB9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Washc4Q3UMB9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Washc4Q3UMB9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Washc4Q3UMB9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Washc4Q3UMB9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Washc4Q3UMB9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Washc4Q3UMB9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Washc4Q3UMB9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Washc4Q3UMB9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Washc4Q3UMB9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Washc4Q3UMB9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Washc4Q3UMB9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Washc4Q3UMB9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Washc4Q3UMB9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Washc4Q3UMB9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms