Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Parp3Q3ULW8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms