Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc33Q3ULW6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms