Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smu1Q3UKJ7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms