Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms