Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms