Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms