Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil3Q3UFQ8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms