Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttll12Q3UDE2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms