Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pid1Q3UBG2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pid1Q3UBG2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms