Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms