Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U6N9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U6N9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U6N9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U6N9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U6N9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms