Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U595 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U595 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U595 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U595 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U595 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U595 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U595 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U595 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U595 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U595 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U595 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U595 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U595 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U595 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U595 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U595 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U595 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U595 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U595 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U595 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U595 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U595 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U595 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U595 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U595 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U595 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U595 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U595 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U595 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U595 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U595 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U595 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U595 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U595 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U595 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms