Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam117bQ3U3E2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam117bQ3U3E2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam117bQ3U3E2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam117bQ3U3E2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam117bQ3U3E2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam117bQ3U3E2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam117bQ3U3E2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam117bQ3U3E2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam117bQ3U3E2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam117bQ3U3E2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms