Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gse1Q3U3C9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms