Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud5Q3U2S4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otud5Q3U2S4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms