Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc174Q3U155 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms