Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88bQ3TYP4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms