Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms