Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms