Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc136Q3TVA9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms