Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1lQ3TTP0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1lQ3TTP0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1lQ3TTP0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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