Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTL0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTL0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTL0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTL0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTL0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms