Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms